Parafia pw. Narodzenia NMP w Borzęcinie powstała w 1364 r.; erygowanie parafii jest związane z założeniem wioski w tym samym roku przez biskupa krakowskiego Bodzanta Jankowskiego. Jedna z hipotez nazwy parafii jest związana z nazwiskiem biskupa Bodzanta (Bodzanta - Bodzantin - Borzęcin).

Za patrona parafii obrano Najświętszą Maryję Pannę w tajemnicy Narodzenia. Tak jest do dziś. Obecny obraz, łaskami słynący, zwany też Matką Bożą Borzęcińską, pochodzi prawdopodobnie z początku XVI w. Przedstawia Madonnę z Dzieciątkiem. Wg podań był umieszczony w drewnianej kapliczce na tzw. "Łonnem", na terenie parafii. Później został przeniesiony do starego, drewnianego kościółka, który był zbudowany po drugiej stronie rzeki Uszwicy, patrząc od obecnego kościoła.

Początki budowy obecnej świątyni sięga XVII w. Budowa nowego kościoła została podyktowana ogromnymi zniszczeniami, jakie dosięgły kościół w czasie najazdu szwedzkiego w latach 1655-1660.

W roku 1680 z inicjatywy proboszcza borzęcińskiego, Krzysztofa Rogozińskiego rozpoczęto budowę nowego kościoła, którą prowadzono etapami.

Z okazji ukończenia budowy kościoła w Borzęcinie, biskup krakowski wydał w 1730 roku dekret następującej treści: "Kościół w Bożęcinku ręką nieprzyjacielską zniszczony, staraniem i troską przewielebnego księdza Krzysztofa Rogozińskiego w mniejszym chórze wybudowany, zostaje ukończony w chórze większym za nowego rektora, przewielebnego księdza Jana Fabińskiego. Dzięki jego pilności i gorliwości staje się stosownym do udzielania sakramentów świętych i urządzania nabożeństw".

Ten kościół jednak nie przetrwał do naszych czasów, bo został zniszczony przez pożar w 1802 r. Odbudowa trwała kilkanaście lat i dopiero w 1854 roku miała miejsce konsekracja świątyni przez biskupa tarnowskiego Józefa Alojzego Pukalskiego.

Pod koniec XIX wieku parafia borzęcińska liczyła blisko 7000 mieszkańców, toteż zachodziła nagląca potrzeba dalszej rozbudowy kościoła co zostało zapoczątkowane przez ks. Józefa Oświęcimskiego a uwieńczone sukcesem i ofiarną pracą ks. Ludwika Kozaka i parafian. Ostateczny i obecny wygląd kościoła zawdzięczamy architektowi ze Lwowa, profesorowi Jan Sas - Zubrzyckiemu.

W 1925 roku z parafii Borzęcin wyłączono Bielczę, zaś w 1936 Borzęcin Dolny i utworzono tam parafie.

Obecnie parafia liczy 3040 wiernych. Trzeba jednak nadmienić iż w ostatnich latach znaczna ilość młodych parafian wyjechała za pracą do krajów Europy Zachodniej, przede wszystkim do Anglii, co zauważa się też na frekwencji w niedzielnych Mszach świętych.